微生物检测仪专门用来检测食品中的微生物，食品微生物污染会严重影响人们的身体健康，在许多地区因为没有安全的仪器来处理人畜粪便和食物残留物，这就为有害微生物、寄生虫等提供了理想的繁殖场所。

利用食品微生物检测仪在这种环境条件下尤其重要，垃圾和粪便不仅会直接传染疾病，还会造成食物和饮水的污染，造成食物中多种致病微生物快速繁殖，造成各种食源性疾病的感染和泛滥。

很多食物引起的疾病，在损害人体消化、吸收能力的同时，还会引起代谢变化、营养消耗和生理障碍。单纯的营养不良或食源性疾病并发，都会对人体造成严重伤害。对孩子而言，就会阻碍智力发展，还阻碍身体成长。对成年人而言，生产能力会严重下降，尤其在有缺铁性贫血的情况下，尤其如此。

无论是从食物还是环境中产生的，营养不良也能严重破坏人体抵抗感染或毒素的能力，造成同样的后果。判断经由消化道感染所致疾病的程度，是一件很棘手的事，而且要判断这些由食物引起的食源性疾病的比率，也更为困难。所以微生物检测仪的应用很有必要，它可以一定程度上从源头阻挡危害物进入人们的身体，从而保障人们的身体健康。